Pada 21 November 2013, Paus Fransiskus menunjuknya sebagai Uskup Bogor, dan ia ditahbiskan pada 22 Februari 2024, menggantikan Mgr. Cosmas Michael Angkur, O.F.M yang pensiun.
Penahbisannya bertepatan dengan Pesta Takhta Santo Petrus, dengan motto “Magnificat anima mea dominum” yang berarti “Jiwaku memuliakan Tuhan” (Luk 1:46).
Kini, Mgr. Paskalis Bruno Syukur menjabat sebagai Ketua Komisi Kateketik KWI, fokus pada tugas pastoral untuk keluarga Katolik di Indonesia. Pada 6 Oktober 2024, Paus Fransiskus mengangkatnya sebagai kardinal keempat dari Gereja Katolik Indonesia.
