Naik ke MotoGP, Marquez langsung mencatatkan prestasi gemilang. Dalam musim debutnya, ia berhasil meraih gelar juara dunia MotoGP.
Kesuksesan ini ia ulang pada tahun berikutnya, membuatnya menjadi juara dunia dua tahun berturut-turut.
Meski kehilangan gelar pada 2015 setelah direbut Jorge Lorenzo, Marquez bangkit dan mencetak quat-trick dengan menjadi juara dunia MotoGP empat kali beruntun dari 2016 hingga 2019.
Di balik kesuksesannya, Marc Marquez menuai kontroveri dari gaya balapnya yang membahayakan.
Ia pernah bersitegang dengan legenda MotoGP, Valentino Rossi, akibat cara balapnya yang membahayakan.
Seiring berjalannya waktu, performanya mulai menurun, terutama akibat cedera yang mengganggu kariernya.
Joan Mir berhasil merebut gelar juara dunia MotoGP saat Marquez sedang menghadapi masalah cedera.
Pada tahun 2022, Marc Marquez kembali terpaksa mundur dari kompetisi karena cedera pada lengan kanannya yang pernah patah.
Meski demikian, prestasinya tetap diakui. Marc Marquez tetap menjadi salah satu pembalap yang disegani di MotoGP dan diperkirakan akan kembali bersinar di musim depan.
